НДС, в возмещении которого было отказано по причине пропуска трехлетнего срока на заявление соответствующего вычета, не может быть включен в состав внереализационных расходов в целях исчисления налога на прибыль организаций.
Общество посчитало сумму НДС, в возмещении которой было отказано, безнадежной к взысканию задолженностью, которая может быть признана в составе внереализационных расходов. Кроме того, в обоснование своей позиции налогоплательщиком было указано, что спорные затраты на уплату НДС были связаны с извлечением дохода посредством эксплуатации построенного морского терминала.
Отказывая налогоплательщику в передаче жалобы для рассмотрения в судебном заседании Судебной коллегии по экономическим спорам и соглашаясь с нижестоящими судами, судья ВС РФ указала на то, что признать "входной" НДС в составе расходов по налогу на прибыль можно только по правилам ст. 170 НК РФ в случае его учета в стоимости товаров (работ, услуг), в том числе основных средств и нематериальных активов. Нормы ст. 171, 172 НК РФ носят императивный характер, в связи с чем налогоплательщик может или принять НДС к вычету по правилам этих статьей НК РФ или учесть НДС в стоимости товаров (работ, услуг) по правилам ст. 170 НК РФ.
Суды посчитали, что предлагаемый Обществом способ учета не возмещенного НДС в качестве безнадежной к взысканию задолженности вступает в противоречие с действующим механизмом правого регулирования порядка учета и возмещения НДС.